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关于进一步明确畜禽粪污还田利用要求强化养殖污染监管的通知中，鼓励畜禽粪污还田利用，明确还田利用标准规范，要求养殖场户应当切实履行粪污利用和污染防治主体责任，相关部门强化粪污还田利用过程监管。
《农业农村部办公厅、生态环境部办公厅关于促进畜禽粪污还田利用依法加强养殖污染治理的指导意见》明确，到2025年，畜禽粪污综合利用率达到80%；到2035年，畜禽粪污综合利用率达到90%。
目前，养殖污染仍然是受到重点关注的农业面源污染类型之一，其在我国畜禽养殖规模化快速发展的当下显得尤为突出。不过，经过数十年的努力，我国畜禽养殖污染治理也取得了不错的成绩。
总的来说，我国畜禽养殖粪污治理还面临根本观念的转变，例如将种养结合这种现代化，符合绿色节能要求的养殖模式推广出去，还需要更科学的解决方案和强有力的制度、标准支撑。
同时，我国畜禽养殖粪污治理也要着重因地制宜改善技术路线。就这点来看，目前，养殖污染防治技术的发展在整体和系统工艺方面的研究和突破还较少。但受到地域、温湿度、经纬度、养殖模式、配套基建等因素影响的畜禽养殖在治污方面更需要成套技术解决方案。
另外，畜禽养殖粪污处理迫在眉睫的一点还在于养殖污水治理。抓住这个主要矛盾，也是必要的。原因就在于，养殖污水对地下水、河流、湖泊、土壤等的影响更明显，周期也更短一些。
而如果关涉到水产养殖污水的处理，则可能不止会影响到江河湖，甚至将与海洋蓝色经济产业发展的高质量转型和可持续挂钩。
为此，水专项不仅开辟了畜禽养殖专题，还涉足了成套技术集成、管理机制等方面的系统研究。
截至目前，相关的水专项研究已经公开了30多项禽养殖污染治理的适用技术，包括移动式生态养殖、山地果园种养结合养殖、粪污资源化利用、沼液能源化利用、滞留塘生态净化系统构建等一系列成果。
同时，“十一五”至今,通过水专项的研究,共发布12项与养殖污染控制相关的技术规范或指南。包括《畜禽养殖业污染治理工程技术规范》、《江苏省污水生物净化处理技术规程》等。
目前，水专项研究攻克了微生物发酵床生态养殖、饲料微生物添加等多项技术难题，以养殖污染生态控制为主的种养加一体化控制方案已推广到20多个省市。
未来，畜禽养殖污染治理仍会专注于养殖污染管控、粪污资源化利用、种养结合的适用模式等领域，积极推动绿色农牧业现代化体系的构建。
